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    科研進(jìn)展

    Biosensors and Bioelectronics|深圳先進(jìn)院等實現(xiàn)對多種呼吸道病毒及其變種的精準(zhǔn)檢測

    發(fā)布時間:2023-10-07 來源:深圳先進(jìn)技術(shù)研究院

      中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院生物醫(yī)學(xué)與健康工程研究所楊慧研究員團隊,與深圳市兒童醫(yī)院麻曉鵬、謝中建團隊合作,在Biosensors and Bioelectronics上發(fā)表了題為CRISPR/Cas12a-Assisted isothermal amplification for rapid and specific diagnosis of respiratory virus on an microfluidic platform的文章該研究開發(fā)了一種基于CRISPR/Cas12a和等溫擴增技術(shù)(LOC-CRISPR)的簡單、全封閉、高度集成的微流控系統(tǒng),可以特異性識別多種常見呼吸道病毒及其變種。本研究中,沈杰男博士、陳摯博士和謝瑞彬共同第一作者,麻曉鵬院長、楊慧研究員和謝中建教授為共同通訊作者深圳市兒童醫(yī)院與中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院為通訊單位    

      呼吸道病毒是導(dǎo)致呼吸道感染的主要因素之一,包括冠狀病毒、流感病毒呼吸道合胞病毒(RSV)等。在兒童和老年人等高風(fēng)險人群中,病毒感染導(dǎo)致的死亡率極高。傳統(tǒng)的診斷方法通常需要復(fù)雜的實驗設(shè)備和較長的檢測周期,且存在著高成本、低靈敏度等問題。并且傳統(tǒng)的PCR技術(shù)只能確定病毒類型,如果要檢測同一病毒的不同變異株,就需要進(jìn)行昂貴且耗時的基因測序。為了解決上述問題,研究人員開發(fā)了一種名為LOC-CRISPR的新技術(shù),它基于CRISPR/Cas12a和等溫擴增技術(shù),是一種簡單、全封閉、高度集成的微流控系統(tǒng)。該系統(tǒng)可以對SARS-CoV-2(新冠)及其變異株(BA.1、BA.2和BA.5)、H1N1(甲型流感病毒)、H3N2(甲型流感病毒)、IVB(流感病毒)和HRSV(呼吸道感染病毒)的進(jìn)行精準(zhǔn)識別。在臨床樣本測試中,研究團隊使用LOC-CRISPR芯片分析了50份鼻咽拭子樣本(44份陽性和6份陰性),并獲得了優(yōu)異的靈敏度(97.8%)和特異性(100%)。    

      該系統(tǒng)中,研究人員在LOC-CRISPR芯片中集成了核酸提取、核酸擴增和熒光檢測三個功能區(qū)。并且LOC-CRISPR芯片還設(shè)計了用于多重檢測(兩個樣本輸入和十個結(jié)果輸出)需求的特殊結(jié)構(gòu)。該系統(tǒng)中的另一項關(guān)鍵技術(shù)是CRISPR/Cas12a技術(shù),它是一種基于RNA導(dǎo)向的基因編輯技術(shù),能夠通過特異性識別和切割DNA序列,具有高度特異性和高效率的特點。研究團隊利用CRISPR/Cas12a的導(dǎo)向作用,將其與等溫擴增技術(shù)相結(jié)合,減少檢測步驟,降低檢測時間,不僅實現(xiàn)了呼吸道病毒的種類識別,而且還實現(xiàn)了對新型冠狀病毒的不同變異株之間的堿基序列識別。 

      總之,該項研究的進(jìn)展,具有將實驗室科學(xué)帶入社區(qū)診所的能力,是診斷技術(shù)領(lǐng)域的一個重大突破。未來,隨著針對多種疾病診斷試劑的持續(xù)開發(fā),該款微流控芯片將在疾病預(yù)防、健康監(jiān)測以及個性化醫(yī)療方面,具有巨大的潛力和應(yīng)用價值,值得各方關(guān)注和期待。 


    LOC-CRISPR系統(tǒng) 

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