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    科研進(jìn)展

    Nature Machine Intelligence | 深圳先進(jìn)院提出自由社交行為的人工智能精細(xì)化分析方法

    發(fā)布時(shí)間:2024-01-09 來(lái)源:深圳先進(jìn)技術(shù)研究院

      社交行為是高等哺乳動(dòng)物重要的本能行為,社交障礙是自閉癥、抑郁癥以及社交焦慮癥等疾病的高度共有病征,社交行為的讀取與解析是研究社交障礙神經(jīng)環(huán)路機(jī)制關(guān)鍵技術(shù)之一。 

      1月8日,中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院腦所/深港腦科學(xué)創(chuàng)新研究院蔚鵬飛研究員團(tuán)隊(duì)在人工智能領(lǐng)域國(guó)際頂級(jí)期刊《自然 機(jī)器智能》(Nature Machine Intelligence) 期刊發(fā)表了題為 Multi-animal 3D social pose estimation, identification, and behavior embedding with a few-shot learning framework的論文,發(fā)布了神經(jīng)環(huán)路研究領(lǐng)域一項(xiàng)突破性應(yīng)用技術(shù):針對(duì)社交行為研究的小樣本學(xué)習(xí)計(jì)算框架模型Social Behavior Atlas (以下簡(jiǎn)稱“SBeA”) 

      該技術(shù)實(shí)現(xiàn)了自由社交動(dòng)物模型的無(wú)標(biāo)簽、高精度三維姿態(tài)估計(jì)、零樣本身份識(shí)別和精細(xì)化社交行為分類,真正解決了精確檢測(cè)動(dòng)物社交行為的多個(gè)重要難點(diǎn),有望為社交行為神經(jīng)環(huán)路機(jī)制的研究帶來(lái)研究范式上的變革創(chuàng)新。該工作為科技創(chuàng)新2030-“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目“社交障礙的神經(jīng)環(huán)路機(jī)制與干預(yù)研究”的實(shí)施,提供了重要的精細(xì)行為數(shù)據(jù)分析支撐 

      近年來(lái),深度學(xué)習(xí)技術(shù)在傳統(tǒng)行為學(xué)研究領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,促進(jìn)了計(jì)算神經(jīng)行為學(xué)(computational neuroethology)這一新興學(xué)科的蓬勃發(fā)展,DeepLabCut、SLEAP、MoSeq等AI動(dòng)物行為追蹤技術(shù)正在成為神經(jīng)科學(xué)家的重要研究工具。但是在多目標(biāo)、自由社交行為的研究領(lǐng)域,盡管上述技術(shù)都相繼推出了自己社交行為分析版本,但是在海量數(shù)據(jù)標(biāo)注問(wèn)題連續(xù)追蹤的身份準(zhǔn)確性等問(wèn)題上的技術(shù)不成熟,使得目前研究人員仍沒(méi)有真正可用的有效工具,社交行為的研究大部分仍停留在傳統(tǒng)三廂行為實(shí)驗(yàn)階段。 

      上述現(xiàn)有歐美技術(shù)的性能首先受制于人工標(biāo)注數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)量。在社交行為實(shí)驗(yàn)中,無(wú)法避免地需要在多種行為實(shí)驗(yàn)范式中使用不同的模式動(dòng)物,深度學(xué)習(xí)模型精準(zhǔn)與否取決于實(shí)驗(yàn)人員標(biāo)注的視頻的數(shù)量,每一個(gè)數(shù)據(jù)集的準(zhǔn)備都需要花費(fèi)實(shí)驗(yàn)人員數(shù)周的時(shí)間,極大地降低了實(shí)驗(yàn)效率,限制了上述工具的應(yīng)用場(chǎng)景。SBeA在自由社交動(dòng)物的姿態(tài)估計(jì)、身份識(shí)別和行為分類的三個(gè)階段,分別針對(duì)性地提出了小樣本的數(shù)據(jù)生成算法、零樣本雙向遷移學(xué)習(xí)方法和自然結(jié)構(gòu)啟發(fā)的無(wú)監(jiān)督社交行為分解聚類策略,有效降低了每個(gè)階段的數(shù)據(jù)標(biāo)注量。 

      SBeA的姿態(tài)估計(jì)小樣本數(shù)據(jù)生成算法和身份識(shí)別零樣本雙向遷移學(xué)習(xí)方法的設(shè)計(jì)均受到大腦的工作機(jī)制的啟發(fā)(圖1)。人類在識(shí)別交互的動(dòng)物時(shí),能 “腦補(bǔ)”動(dòng)物可能存在的遮擋關(guān)系,這一過(guò)程為大腦提供大量的新數(shù)據(jù)。據(jù)此所提出的連續(xù)遮擋復(fù)制粘貼數(shù)據(jù)算法可以有效合成大量新數(shù)據(jù)(圖1a),能夠訓(xùn)練精度更高的模型,獲得更加準(zhǔn)確的3D社交姿態(tài)估計(jì)結(jié)果。在非社交場(chǎng)景中,人類能夠通過(guò)外表區(qū)分每一只動(dòng)物的身份,也能“腦補(bǔ)”到多動(dòng)物社交場(chǎng)景,識(shí)別每一只動(dòng)物的身份。受到啟發(fā),SBeA的多動(dòng)物社交身份識(shí)別通過(guò)共享不同網(wǎng)絡(luò)的知識(shí)實(shí)現(xiàn)雙向遷移學(xué)習(xí)(圖1b),借助模型之間的“腦補(bǔ)”,消除了標(biāo)注數(shù)據(jù)的過(guò)程,并實(shí)現(xiàn)了高精度的外表相似動(dòng)物的身份識(shí)別。   

      多動(dòng)物社交行為分析最大的難點(diǎn)在于同時(shí)區(qū)分外觀非常相似的動(dòng)物。兩只小鼠在自由社交時(shí),區(qū)分它們的身份是研究特定疾病造模個(gè)體的基礎(chǔ),然而即使是專業(yè)的實(shí)驗(yàn)人員也很難區(qū)分每一只的身份。零樣本雙向遷移學(xué)習(xí)借助人工智能超越人類精度的圖像特征分辨能力,實(shí)現(xiàn)了大于90%的自由社交動(dòng)物身份識(shí)別準(zhǔn)確率(圖2),推動(dòng)社交行為研究進(jìn)入不需要約束動(dòng)物的自然行為時(shí)代,革新社交實(shí)驗(yàn)范式。   

      動(dòng)物行為具有類比人類語(yǔ)言的“字母-單詞-語(yǔ)句”結(jié)構(gòu),社交行為則包含動(dòng)物與動(dòng)物之間行為語(yǔ)言結(jié)構(gòu)的交互。根據(jù)社交行為的自然結(jié)構(gòu),將社交行為類比語(yǔ)言進(jìn)行并行、動(dòng)態(tài)的分解,綜合考量多種社交行為特征進(jìn)行社交行為的自適應(yīng)無(wú)監(jiān)督聚類,獲得百余種精細(xì)社交行為模塊(圖3)。SBeA不需要提前定義社交行為類別,有利于發(fā)現(xiàn)新的、未定義的社交行為差異。SBeA能夠鑒定三箱社交、分區(qū)域社交等經(jīng)典社交實(shí)驗(yàn)范式難以獲得的自由社交行為表型。使用SBeA,鑒定得到孤獨(dú)癥小鼠模型和正常小鼠兩兩之間社交的精細(xì)行為差異(圖4),孤獨(dú)癥小鼠模型缺少的相互理毛、同伴嗅探和增加的原地不動(dòng)、刻板的同步行為顯示出自然狀態(tài)下孤獨(dú)癥小鼠模型親社會(huì)樣行為的缺失、社交新穎性和運(yùn)動(dòng)能力的降低。僅通過(guò)社交行為的差異即可分類孤獨(dú)癥小鼠社交組和正常小鼠社交組,證明了SBeA具有通過(guò)社交行為來(lái)識(shí)別異常小鼠的能力。   

       除了小鼠外,SBeA也適用于計(jì)算鳥(niǎo)類和家犬的精準(zhǔn)的3D社交姿態(tài)、身份和精細(xì)社交模塊,具有跨物種應(yīng)用的潛力5。家犬部分的工作與中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所張亞平院士和王國(guó)棟研究員團(tuán)隊(duì)、公安部昆明警犬基地李靜團(tuán)隊(duì)合作,在科技創(chuàng)新2030“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目支持下共同完成。   

      深圳先進(jìn)院腦所蔚鵬飛研究員為論文的通訊作者。論文第一作者是深圳先進(jìn)院腦所在讀博士生韓亞寧,共同第一作者包括碩士生陳可(現(xiàn)就職芯動(dòng)科技)和助理研究員王云珂(現(xiàn)就職微創(chuàng)醫(yī)療)。研究的開(kāi)展要大力感謝深圳先進(jìn)院腦所王立平研究員的關(guān)懷與指導(dǎo),同時(shí)感謝已畢業(yè)博士黃康(現(xiàn)就職深圳一灣生命科技)的積極支持。感謝科技部科技創(chuàng)新2030“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)、中國(guó)科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國(guó)科學(xué)院腦聯(lián)結(jié)解析與調(diào)控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和廣東省腦連接圖譜重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的資助與支持。 

     

    1 小樣本連續(xù)遮擋復(fù)制粘貼數(shù)據(jù)生成算法 

    (a)和零樣本雙向遷移學(xué)習(xí)方法 (b)示意圖

    2  外觀相似動(dòng)物的身份識(shí)別準(zhǔn)確率>90% 

     

    3  自然行為結(jié)構(gòu)啟發(fā)的社交行為動(dòng)態(tài)分解和聚類流程圖  

       

    4  SBeA鑒定孤獨(dú)癥小鼠多種異常的精細(xì)社交行為模塊 

    5  SBeA量化鳥(niǎo)類和家犬的精細(xì)社交行為 

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