????面對不斷加劇的全球氣候變暖趨勢,聯(lián)合國秘書(shū)長(cháng)安東尼奧·古特雷斯在2023年7月舉行的聯(lián)合國氣候問(wèn)題新聞發(fā)布會(huì )的開(kāi)幕致辭中稱(chēng):“全球變暖的時(shí)代已經(jīng)結束,全球沸騰的時(shí)代已經(jīng)來(lái)臨!”。近些年我們也直觀(guān)的感受到高溫熱浪事件頻率和強度的增加,這不僅影響了人類(lèi)的生產(chǎn)和生活,同時(shí)也嚴重影響了植物的生長(cháng)和存活。尤其在城市環(huán)境中,由于受“熱島效應”的影響,城市植物對高溫熱浪事件的響應更加敏感。然而,植物在自然高溫熱浪事件下葉片損傷的生理生態(tài)基礎仍不明晰。2022年夏天,我國多地經(jīng)歷了持續近兩個(gè)月的高溫,特別是長(cháng)江沿岸多座城市的氣溫超過(guò)了高溫閾值或歷史極值。因此,準確評估植物的耐熱性對于預測其在熱脅迫下的生存能力以及選擇耐熱物種至關(guān)重要。????中國科學(xué)院華南植物園生態(tài)中心植物生理生態(tài)研究組(PI葉清研究員)科研人員,實(shí)地測定了長(cháng)江沿岸五個(gè)城市100多種木本植物的葉片損傷率、葉片耐熱指標和葉片經(jīng)濟性狀。研究發(fā)現植物葉片習性影響光合耐熱性。通過(guò)對比常綠樹(shù)種和落葉樹(shù)種,發(fā)現葉片構建成本較高的常綠樹(shù)種耐熱性高于落葉樹(shù)種(圖1),并指出落葉樹(shù)種可能采取部分落葉的“避熱”策略以保證在高溫熱浪事件下的存活。同時(shí),葉片熱敏感性與自然條件下葉片損傷率的顯著(zhù)相關(guān)性,提供了一個(gè)預測熱浪下植物葉片損傷情況的潛在指標(圖2)。目前的研究從葉片光合耐熱性和葉經(jīng)濟譜的角度探討了自然高溫熱浪事件下葉片損傷的生理生態(tài)基礎,未來(lái)的研究還需考慮更多的生理性狀,以更全面理解植物對高溫熱浪的響應與適應機制。????相關(guān)研究成果已近期發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊Functional Ecology(封面文章)和Science of the Total Environment上。華南植物園碩士研究生張浩萍、博士后寧秋蕊分別為論文的第一作者,劉慧副研究員為論文的通訊作者。該研究得到國家自然科學(xué)基金、中國博士后科學(xué)基金等項目資助。論文鏈接:https://doi.org/10.1111/1365-2435.14562https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.170022???圖1.?常綠樹(shù)種與落葉樹(shù)種基于18個(gè)功能性狀的主成分分析圖2. 極端高溫事件下植物葉片損傷情況及與耐熱性的相關(guān)性(a)-(d)高溫熱浪事件下野外葉片損傷圖片;(e) 131個(gè)物種葉片耐熱相關(guān)指標與葉片損傷的相關(guān)性。
近日,中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院的王濤課題組與王杰課題組合作在Nature Communications雜志發(fā)表了題為Perturbation of METTL1-mediated tRNA N7-methylguanosine modification induces senescence and aging的研究成果。近日,中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院的王濤課題組與王杰課題組合作在Nature Communications雜志發(fā)表了題為“Perturbation of METTL1-mediated tRNA N7- methylguanosine modification induces senescence and aging”的研究成果。該研究揭示了METTL1/WDR4介導的tRNA-m7G修飾對于維持衰老過(guò)程中蛋白質(zhì)組穩態(tài)的重要作用,研究結果闡明了tRNA修飾對于衰老的調控作用。蛋白穩態(tài)失衡(Collapse of Proteostasis)是衰老的一個(gè)重要特征(Hallmarks of Aging),表現為蛋白質(zhì)非正常折疊和異常聚集。衰老過(guò)程中多個(gè)因素共同作用導致蛋白穩態(tài)失衡,一方面,由于衰老而導致蛋白發(fā)生翻譯異常包括錯誤氨基酸摻入、異常折疊和不完整蛋白隨著(zhù)衰老進(jìn)程逐漸積累,另一方面,細胞的大分子自噬體系(溶酶體,蛋白酶體和分子伴侶)水平或功能降低導致異常蛋白質(zhì)不能及時(shí)清除而積累,這兩方面的因素共同作用引起細胞蛋白質(zhì)組發(fā)生改變從而誘導衰老的發(fā)生。增強自噬的策略例如抑制mTORC1活性,節食和運動(dòng)均能夠明顯延緩模式動(dòng)物的壽命。然而,衰老過(guò)程中為何會(huì )發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯異常的原因仍然不清楚。研究團隊發(fā)現METTL1/WDR4不僅在三種衰老細胞模型而且在衰老的小鼠肝腎等組織中表達水平下調。FlucDM-GFP報告蛋白分析和衰老相關(guān)分析結果表明,敲降或敲除METTL1增加非正常折疊蛋白的聚集,加速細胞衰老;維持METTL1的表達則減少蛋白的聚集,延緩衰老進(jìn)程。全身性可誘導敲除Mettl1顯著(zhù)加速小鼠衰老進(jìn)程,其壽命只有6個(gè)月;過(guò)表達Mettl1可以明顯促進(jìn)順鉑-阿霉素誘導的肝腎損傷的修復。機制研究表明,衰老伴隨的RNA尤其是tRNA的m7G修飾水平降低導致一部分tRNA進(jìn)入RTD途徑加速降解從而引起tRNA的供給不足,導致核糖體長(cháng)時(shí)間停滯于mRNA對應的密碼子位置,激活了整合應急反應(ISR)和核糖體毒性應急反應(RSR),前者通過(guò)磷酸化eIF2α抑制了細胞全局蛋白質(zhì)合成的起始,后者通過(guò)磷酸化p38上調SASP炎癥因子分泌;另一方面,細胞周期蛋白和Wnt信號通路的蛋白質(zhì)在翻譯水平也被抑制。兩方面的因素共同作用促進(jìn)衰老的發(fā)生。該研究還驗證了轉錄因子sp1對于Mettl1和Wdr4的轉錄調控作用。衰老進(jìn)程中sp1顯著(zhù)降低,可能是m7G修飾復合物下調的一個(gè)重要調控因素。先前研究揭示了METTL1/WDR4介導的RNA-m7G修飾參與干細胞分化、神經(jīng)發(fā)育以及癌癥的發(fā)展,此項研究不僅揭示了m7G修飾調控衰老進(jìn)程這一新的生理功能,而且闡明了引起衰老相關(guān)的蛋白穩態(tài)失衡的一條新的上游信號途徑,這項結果為健康衰老的干預策略提供新的可能途徑。 ????????????????????????????????該研究由中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院王濤課題組與王杰課題組共同完成。王濤課題組付雨棟等人完成實(shí)驗部分,王杰課題組江帆完成數據的生物信息分析。王濤研究員和王杰研究員為文章的通訊作者。廣州醫科大學(xué)Dominique Ferrandon教授,中山大學(xué)附屬第一醫院林水賓教授、陳德猛教授,中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院張小飛研究員、劉晶研究員和西湖大學(xué)裴端卿教授對本文提供了寶貴的建議和幫助。論文鏈接圖1?揭示了METTL1介導的tRNA修飾調控衰老的作用模式
近日,中國科學(xué)院南海海洋研究所熱帶海洋環(huán)境國家重點(diǎn)實(shí)驗室(LTO)唐世林團隊在遙感數據重構研究方面取得新進(jìn)展,實(shí)現了南海多源遙感高分辨率海表葉綠素逐日產(chǎn)品的精準重構。相關(guān)研究發(fā)表在期刊Earth System Science Data上,副研究員葉海彬為論文第一作者,研究員唐世林為通訊作者,合作者包括自然資源部南海預報減災中心正高級工程師楊超宇,LTO副研究員董園和研究員陳楚群。受天氣條件、衛星傳感器運行故障等因素影響,衛星遙感海表面葉綠素產(chǎn)品存在大量,無(wú)規律的缺失。觀(guān)測數據的不完整性也阻礙了衛星數據在海洋研究領(lǐng)域中的應用。因此,研究衛星遙感數據的重構方法,對在關(guān)注海域獲得時(shí)空連續完整的數據,以及提高數據的利用效率有重要意義。本研究結合最優(yōu)插值(OI)方法和深度學(xué)習網(wǎng)絡(luò )框架SwinUnet,構建了基于數據異常預期方差的深度學(xué)習模型OI-SwinUnet。該方法利用最優(yōu)插值,基于空間鄰域信息對衛星觀(guān)測和現場(chǎng)觀(guān)測數據進(jìn)行融合,同時(shí)利用SwinUnet對大區域長(cháng)時(shí)序的遙感觀(guān)測時(shí)間序列數據進(jìn)行多尺度特征學(xué)習,最終重建缺失的葉綠素a濃度數據,進(jìn)而獲得南海區域逐日1km海表葉綠素產(chǎn)品。本研究重構的南海海表葉綠素數據集不僅可以很好地描繪南海季節尺度的海表葉綠素a時(shí)空變化規律,還可以再現天氣尺度的海洋現象快變過(guò)程,為進(jìn)一步深入認識和理解南海多尺度動(dòng)力過(guò)程的生態(tài)效應提供了可靠的基礎數據。該研究由廣東省特支計劃項目和南海所自主部署項目等共同資助完成。相關(guān)論文信息:Haibin Ye,Chaoyu Yang,Yuan Dong,Shilin Tang*,and Chuqun Chen. A daily reconstructed chlorophyll-a dataset in the South China Sea from MODIS using OI-SwinUnet. Earth System Science Data,2024,16,3125-3147.文章鏈接:https://doi.org/10.5194/essd-16-3125-2024圖1. OI-SwinUnet深度學(xué)習數據重構網(wǎng)絡(luò )框架圖2. 基于OI-SwinUnet重構的南海海表葉綠素每月平均產(chǎn)品(數據時(shí)間:2013-2017年)